เมื่อวันที่ 30 เม.ย. ที่ห้องประชุมสมาคมฟุตบอลแห่งประเทศไทยฯ นายองอาจ ก่อสินค้า เลขาธิการสมาคมฟุตบอลแห่งประเทศไทยฯ ร่วมกับ นายบพิธ โกมลภิส ผู้อำนวยการโครงการมูลนิธิไทยคม ทำพิธีจับสลากประกบคู่การแข่งขันฟุตบอล "มูลนิธิไทยคม เอฟเอ คัพ 2013" รอบ 3 หรือรอบ 32 ทีมสุดท้าย ผลปรากฏว่า
บางกอกกล๊าส พบ ชลบุรี,
ภูเก็ต(ด.1) พบ ราชบุรี(ไทยพรีเมียร์ลีก),
ระยอง เอฟซี(ด.1) พบ ปตท.ระยอง(ด.1),
ราชนาวี(ด.1) พบ สิงห์ท่าเรือ(ด.1),
เมืองทอง ยูไนเต็ด(ไทยพรีเมียร์ลีก) พบ สงขลา ยูไนเต็ด(ไทยพรีเมียร์ลีก),
ทีโอที(ไทยพรีเมียร์ลีก) พบ อินทรีเพื่อนตำรวจ(ไทยพรีเมียร์ลีก),
บุรีรัมย์ ยูไนเต็ด(ไทยพรีเมียร์ลีก) พบ ชัยนาท(ไทยพรีเมียร์ลีก),
สมุทรสงคราม(ไทยพรีเมียร์ลีก) พบ ทีทีเอ็ม(ด.1),
พัทลุง(ด.2) พบ นครราชสีมา(ด.1),
เชียงราย ยูไนเต็ด(ไทยพรีเมียร์ลีก) พบ ขอนแก่น(ด.1),
สุพรรณบุรี(ไทยพรีเมียร์ลีก) พบ อาร์มี่ ยูไนเต็ด(ไทยพรีเมียร์ลีก),
ศรีสะเกษ เอฟซี หรือ อีสานยูไนเต็ด(ไทยพรีเมียร์ลีก) พบ บางกอก(ด.1),
โอสถสภา เอ็ม-150 สระบุรี(ไทยพรีเมียร์ลีก) พบ นนทบุรี(ด.1),
ตราด(ด.1) พบ บีบีซียู(ด.1),
บีอีซี เทโรศาสน(ไทยพรีเมียร์ลีก) พบ พัทยา ยูไนเต็ด(ไทยพรีเมียร์ลีก),
แบงค็อก ยูไนเต็ด(ไทยพรีเมียร์ลีก) พบ ประจวบ(ด.2)
โดยทุกคู่จะแข่งขันวันที่ 26 มิ.ย. เวลา 19.00 น.