|
|
| 1 | 2 | 3 |
4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 |
11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 |
18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 |
25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 |
|
|
|
|
|
|
|
|
การสกัด chromosomal DNA ฉบับย่อ
วันนี้จะมาแนะนำวิธีการสกัด chromosomal DNA จากเซลล์ ฉบับย่อๆ ซึ่งผมได้คัดเลือกมาจากหนังสือ Bio-Chem ของคณะตัวเอง อิอิ ซึ่งจะมีขั้นตอนดังต่อไปนี้ 1. การทำลายเยื่อหุ้มเซลล์และเยื่อหุ้มนิวเคลียส โดยใช้ SDS (sodium dodecyl sulphate)ซึ่งเป็น detergent ทำให้เซลล์ ปล่อย DNA-histone complex ที่อยู่ในโครโมโซมออกมา นอกจากนี้ SDS ยังช่วยกำจัด DNase 2. การแยกDNA ออกจาก DNA-histone complex โดยใช้เกลือความเข้มข้นสูง ได้แก่ NaCl 3. กำจัดโปรตีนปนเปื้อนต่างๆ ได้แก่ โปรตีนฮีสโตน เศษเซลล์ และโปรตีนต่างๆภายในเซลล์ ได้หลายวิธีเช่น การใช้เอนไซม์ protease สลายโปรตีน การตกตะกอนโดยใช้ phenol, chloroformและการปั่นตกตะกอน 4. การตกตะกอน DNA โดย 95 % เอธานอลที่แช่เย็นจะไปลดความมีขั้วของสารละลายทำให้ DNA ตกตะกอนแยกออกมา 5. การละลายตะกอน DNA ที่ได้ในน้ำหรือบัฟเฟอร์ที่มีเกลือต่ำ เช่น Tris-EDTA buffer 6. หลังจากที่เราได้ DNA มาแล้ว มันมีจำนวนน้อย ดังนั้น จึงนำตะกอนดังกล่าวเข้าเครื่อง PCR (Polymerase Chain Reaction) เพื่อเพิ่มปริมาณจำนวน DNA ลักษณะเท่าตัว ซึ่งรายละเอียดนั้นจะกล่าวในครั้งต่อไป 7. เมื่อขยายปริมาณ DNA จนมากพอแล้ว เราก็จะมาแยกโมเลกุลของ DNA ด้วยวิธี Gel Electophoresisโดยอาศัยคุณสมบัติคือ ความแตกต่างของการเคลื่อนที่ของโมเลกุลในสนามไฟฟ้าไปยังขั้วอิเลคโทรดด้วยอัตราเร็วที่ต่างกัน กล่าวง่ายๆเลยก็คือ บังคับให้ โมเลกุลของDNA ซึ่งมีขั้ว(ในที่นี้เป็นขั้วลบ เพราะเป็นกรดนิวคลีอิค)เมื่อเป็นขั้วลบก็จะวิ่งในถาดเจล จากขั้วลบไปยังขั้วบวก ซึ่งยิ่งจำนวนนิวคลีโอไทด์ มากก็จะยิ่งวิ่งได้ช้าลง โมเลกุลขนาดเล็กก็จะวิ่งไปได้ไกลขึ้น ซึ่งรายละเอียดนั้น เอาไว้พูดในภายหลังนะ... 8. ที่นี้ ถ้าเราต้องการตรวจชนิดของยีนที่เราสนใจ เราสามารถใช้วิธี Nucleic Acid Hybridization เพื่อเช็คยีนที่เราสนใจ เช่น ยีนโรคsickle-Cell anemia ว่าคนไข้เป็นโรคดังกล่าวหรือไม่ เมื่อเช็คด้วย DNA probe ซึ่งเป็น probe ที่เราทำขึ้น เพื่อเป็นตัวเช็คนั่นเอง 9. นอกจากวิธี ดังกล่าวแล้ว ยังใช้วิธี RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) ซึ่งเป็นวิธีการที่สามารถวิเคราะห์ยีนที่สนใจได้โดยอาศัยหลักการตัด ของ restriction enzyme โดยเทียบกันว่า ในภาวะปกติ เอนไซม์จะตัดยีนในส่วนตรงนี้ ได้ระยะทางเท่าไร และถ้ายีนที่มีโรคนั้น จะสามารถตัดยีนได้ระยะทางที่เปลี่ยนแปลงไป อย่างไร ซึ่งวิธีนี้สามารถนำไปวิเคราะห์การกลายพันธุ์ของยีนได้ อ่ะลืมบอกไป การที่เราจะเห็นได้ว่า RFLP ตัดที่ตรงไหน ดูได้จากการทำ Hybridization อีกทีหนึ่ง
Create Date : 17 มีนาคม 2550 |
Last Update : 17 มีนาคม 2550 23:23:10 น. |
|
0 comments
|
Counter : 3233 Pageviews. |
|
|
|
| |
|
|