การดูแลสุขอนามัยของอวัยวะเพศชายก็มีความสำคัญมากเท่าเทียมกับการดูแลสุขอนามัยของร่างกายโดยทั่วๆ ไป เพราะความสะอาดของอวัยวะส่วนนั้นย่อมเป็นการป้องกันปัญหาต่างๆ ที่จะเกิดขึ้นกับตัวเองและผู้หญิงคนที่เขารัก

       ผู้ชายที่ขริบหนังหุ้มปลายอวัยวะจะสะอาดมากกว่าผู้ชายที่ไม่ได้ขริบหนังหุ้มปลายไม่มากก็น้อย แต่ผู้ชายที่ไม่ได้ขริบหนังหุ้มปลายและรักษาความสะอาดเป็นประจำสม่ำเสมอก็มีความสะอาดของอวัยวะส่วนนั้นเท่าเทียมกับผู้ชายที่ขริบหนังหุ้มปลายเช่นกัน

    การทำความสะอาดประจำวัน

 - ทุกครั้งที่อาบน้ำจะต้องปลิ้นหนังหุ้มปลายออกมา แล้วทำความสะอาดชำระคราบไคลที่หมักหมมอยู่ภายใต้หนังหุ้มปลายออก คราบไคลดังกล่าวมีคำเรียกหาว่า " ขี้เปียก " เพราะเป็นขี้ไคลที่เปียกๆ และเป็นปัจจัยที่อาจก่อให้เกิดมะเร็งปากมดลูกได้
 - ควรชำระล้างด้วยน้ำสะอาดเท่านั้น แต่ถ้าหมักหมม มีกลิ่นอาจจะใช้สบู่อ่อนๆ ด้วยก็ได้ หลังฟอกสบู่ควรล้างออกด้วยน้ำสะอาดจนหมด
 - ทุกครั้งที่ถ่ายปัสสาวะควรถ่ายจนหมด อย่าให้หลงเหลือมาหยดในภายหลังเพราะอาจจะทำให้เกิดการหมักหมมได้ และเชิ้อแบททีเรียเจริญเติบโต

 การทำความสะอาดภายหลังการมีเพศสัมพันธ์

 - ทำเช่นเดียวกับการทำความสะอาดประจำวัน 
 - ในกรณีที่ใช้เจลหล่อลื่นช่วยในการมีเพศสัมพันธ์ หลังจากเสร็จกิจแล้วควรจะชะล้างเจลหล่อลื่น ออกให้หมดด้วยน้ำสะอาด โดยปกติควรจะใช้เจลหล่อลื่นสูตรน้ำ เพราะทำความสะอาดและล้างออกได้ง่ายด้วยน้ำ ถ้าเป็นเจลหล่อลื่นที่มีน้ำมันเป็นพื้นฐานอาจจะทำให้เกิดการระคายเคืองได้
 - ถ้ามีการสวมถุงยางอนามัยเพื่อการปลอดภัยของการมีเซ็กส์แล้ว ควรจะถอดออกในขณะที่อวัยวะเพศยังคงแข็งตัวอยู่ ด้วยการใช้กระดาษทิชชู่ห่อหุ้มเวลาถอดอย่าให้ถูกมือ เพราะมืออาจมีแผลได้ และควรจะไปชะล้างทำความสะอาดด้วยน้ำสะอาดทันที ซึ่งจะทำให้เจลหล่อลื่นที่เคลือบมากับถุงยางอนามัยหลุดออกไปได้ง่าย
 - ถ้าจะให้ดี การทำความสะอาดอวัยวะเพศก่อนมีเพศสัมพันธ์ก็ย่อมทำให้สะอาดปลอดภัย และทำให้การร่วมรักนั้นมีความสุขสมมากขึ้น


      จำไว้ว่า "ความสะอาด เป็นหัวใจสำคัญของการรักษาสุขอนามัยของอวัยวะเพศชาย "