พระศรีรัตนเจดีย์ เป็นพระเจดีย์ทรงกลมแบบลังกา แบบเดียวกับพระเจดีย์ ๓ องค์ ที่วัดพระศรีสรรเพชญ์ จังหวัดพระนครศรีอยุธยา ก่ออิฐถือปูนประดับกนระเบื้องโมเสกทองที่สั่งทำจากประเทศอิตาลีตั้งอยู่บนฐานเขียงมีมาลัย ๓ ชั้น คั่นด้วยฐานบัวคว่ำบัวหงายรองรับองค์ระฆัง ถัดขึ้นไปเป็นบัลลังก์สี่เหลี่ยมมีเสาหานรองรับปล้องไฉนปล้องไฉนเป็นบัวลูกแก้วเรียงจากใหญ่ไปเล็กจำนวน ๒๐ ชั้น ถัดจากนั้นเป็นปลียอดและหยาดน้ำค้าง ซุ้มประตูทางเข้ามี ๔ ทิศ ทางเข้าเป็นรูปโค้งแหลมมีมุขประตู ๔ ด้าน ทำเป็นหน้าบันประดับช่อฟ้าใบระกา หางหงส์ นาคสะดุ้ง ตอนบนของซุ้มประตูเป็นเจดีย์ย่อ ลักษณะคล้ายกับพระศรีรัตนเจดีย์ บานประตูหูช้างทำด้วยไม้ปิดทองประดับกระจกลงยาลายช่อดอกไม้ กรอบประตูตอนบน จำหลักเป็นรูปพญานาค ๒ ตัว หางชนกันตรงกลางห้อยเศียรลงด้านข้างภายในพระเจดีย์เป็นห้องโถงกลม กลางห้องกางคั่นด้วยฉัตรขาวตรงกับพระเจดีย์องค์เล็กลงรักสีดำ เป็นที่ประดิษฐานพระบรมสารีริกธาตุ ตั้งอยู่บนฐานก่ออิฐถือปูน ๒ ชั้น ฐานล่างแปดเหลี่ยม มี ๔ มุข ฐานบนเป็นบัวหงาย มีลักษณะเหมือนกับพระศรีรัตนเจดีย์ทุกอย่างมีพระเจดีย์ ทรงเครื่อง ๒ หมู่ตั้งประดับอยู่ด้านหลังพระเจดีย์เป็นเจดีย์ทรงเครื่องรูปสี่เหลี่ยมย่อมุมไม้สิบสองปิดทองประดับกระจกตอนบนเป็นบัวกลุ่มต่อด้วยปลีด้านปลายสุดมีลักษณะเป็นหยาดน้ำค้าง องค์เจดีย์ตั้งอยู่บนฐานสิงห์ ๓ ชั้น เชื่อว่าเป็นเจดีย์โบราณประดับพระมณฑป